故事始于御坂美琴听说有人在街上看到了‘她’，但结合那人给出的时间，她确定本人当时并不在场。
原本她只当是别人的玩笑或是认错了人，直到御坂美琴亲眼所见。
那是在今天下午，茶色的短发，常盘台的制服，‘她’就站在一棵树下，仅是背影便让她有些窒息。
美琴深吸一口气，压下胸腔内翻涌的复杂情绪走上前去。
随着对方转过身来，一模一样的长相便映入了她的眼中。
“你…是谁？”震惊的话语不禁说出口来。
御坂妹妹用她那标志性的、毫无起伏的声线声称是自己的‘妹妹’，还称呼自己为‘姐姐大人’。
这世界简直是疯了！
接着美琴开始询问对方为什么会出现在这里，又在这里干些什么。
御坂妹妹没有回答，而是向着某处侧目而去。
随着对方的视线，美琴看到了树枝上有只小猫，它蜷缩着紧紧抓紧树干，非常无辜的样子。
她明白了，对方在这里仅仅是希望救下困在树上的小猫。
当然如果换成她自己，应该也会作出同样的选择。
于是虽然还有些质疑对方的身份，但两人还是合作救下了小猫。
但令她不爽的是，被救下来的小猫完全不亲近自己！
身为学园都市的能力者，而且是最高级Level 5的超电磁炮，即使克制身体也会产生磁场，结果就是小猫这类动物完全不肯亲近自己，这点她认了...
但小猫却非常亲近这个自称为自己‘妹妹’的家伙！
果然这家伙不可能是自己的妹妹！
抱着这样的想法，御坂美琴开始了明目张胆的跟踪，谁让那家伙根本不透露自身的消息。
御坂妹妹对此似乎也并不在意，这也使得两人的距离愈发接近。
于是两人一前一后，接连穿过街道、公园。
期间那家伙不仅还吃掉了自己的冰淇凌，还要自己请客吃汉堡...真敢说啊，明明根本不是自己的妹妹。
但看到对方那张熟悉的面庞时，美琴还是同意了。
为什么呢，明明两人是第一次见面，却做着像亲姐妹一样的事情。
更可恨的是那家伙竟然要霸占自己辛苦得来的‘呱太’徽章！
那家伙完全不谈论自己的事情，还一本正经让自己请客，甚至还将视线投向了自己珍视之物。
不答应，这怎么能答应？
原本是这样想的才对，但在不知不觉中自己已经亲手将‘呱太’徽章佩戴在了对方衣角。
宛如姐姐对妹妹的独宠般，一个下午无论怎样请求她都答应了。
现在想想就连美琴本人也觉得不可思议。
可本应该是这样的才对...
时间回到现在，美琴站在路边，手中还握着刚才送出的‘呱太’徽章。
“那家伙不是说会好好珍惜的么，这才多久就丢掉了？”
环视街道，空无一人，更别说早已失去踪迹的御坂妹妹了。
美琴故作生气道：“真是的，下次绝对不会再便宜她了！”
将捡到的‘呱太’徽章擦了擦，宝贵的放进口袋中，然后转身就要离开了。
心里还在想着：下次遇到那家伙一定要好好教育，随手丢掉别人送的礼物很失礼的！
就在这时，一道黑影从她身前不远处突然闪出。
一把抓住了她的手臂，二话不说就要将她带走。
这是哪来的小混混，也太明目张胆了吧？
美琴心中两份怒气蹭蹭叠加，于是电光在她的手臂跳跃，直接轰入前方之人的体内。
那黑色身影仿佛没有防备，被电后直接放开手臂。
美琴有些诧异。
自己虽然减轻了电力的输出，可电晕一个人也是轻轻松松，怎么这人还是生龙活虎的样子，仿佛刚才根本没有受到伤害。
而且她很确定，再次之前根本没见过眼前之人。
黑色短发与双眸，再加上那与黑夜融为一体的大衣，更引人注目的是其背后的双剑。
现在还用冷兵器，真是个怪人。
而对方的表情也是十分异常。
先是吃惊，像是没有预料到自己会动手，紧接着似乎又恍然大悟：“你是...本人？”
“什么本人？拜托说些能听懂的话。”
桐人彻底明白了现状。
从结衣那里得来的情报一直都很准确，但他们都忽略了一个重要的存在，那就是眼前的御坂美琴本人！
作为所有御坂妹妹的基因提供者，她们不说长的非常相似吧，那也是一模一样。
在外面都能被人认做双胞胎的程度，想必结衣也是因此将其囊括了进来。
而桐人则是因为之前的成功，这才没有多想，下意识的将对方也当成了御坂妹妹。
美琴见对方在想事情，便开口追问：“喂，你这家伙给我说清楚，本人是什么意思？”
凭借直觉，她觉得这件事情跟‘妹妹’有很大的关系。
但详细事情太过复杂，桐人哪有这个功夫解释？
既然这次搞错的对象，那一方通行便在其他地方进行着实验。
时间要赶不上了！
桐人迅速查看地图，果然上面还存在着另一处实验地点。
于是当即召出次元壁，转身就要离开。
可美琴哪能放过，她还没问清自己‘妹妹’到底发生了什么，怎么能让对方离开？
她上前抓住桐人大衣衣角，誓要问个清楚。
“真是麻烦。”桐人没有解释什么，只是付出了行动：“既然如此你也一起过来，反正早晚都是要面对的事情。”
“等等，要去呢？”
虽然御坂美琴是学园都市排名第三的Level 5，但在不使用能力的情况下，完全无法抗衡桐人49级角色的力量。
桐人仅仅是正常行走，所形成的力量便足以将美琴拖着前进。
美琴也是第一次见到次元壁这种事物，显得有些不知所措，但又见对方完全不在意的样子，她还是提醒道：“这是什么...要撞上去了！”
直至两人的身影彻底消失在了次元壁当中。
当美琴回过神来时，两人已经身处另一处区域了。