朱载坖很快收到了行勘钦差们的讯问笔录，涉事的诸位官员们都矢口否认自己和李三才的朦胧推升有关系，这点朱载坖已经有所预料了，不过现在对于李三才，朱载坖现在是有点好奇了，能够被朱载坖贬黜之后，再次升迁，这还是有些本事的。
所以朱载坖之前就命令厂卫调查李三才，主要是围绕两个问题，第一就是李三才居官的表现，第二就是李三才的为官情况等事项，朱载坖认为，李三才能够在吏部想到办法，为其朦胧推升，说明李三才还是很有办法的，对于大明这些官员，朱载坖还是很了解的，尽管他们有乡党等各种人情关系等往来，但是要他们办事，没有银钱也是玩玩不能的，尤其是吏部等官吏，那可是手握铨选大权的官员。
而且吏部的官吏之前常常沆瀣一气，一起贪污，吏部吏员匿优缺，待价而沽，谋取私利，以致选人壅滞，这些事情在之前是很常见的事，在之前，吏部自察的成效高度依赖吏 部主官乃至各级官员的个人素质品行，一旦各级官员缺乏相应能力甚至同流合污， 便无从制衡，尤其是随着吏员出身者完全沉沦末流，吏部各科办事吏员无正途出路， 自然转以谋财为先。
杨博担任吏部尚书的时候，也曾经感叹道：“每次大选都吏当该所得不下数千余金，玩弄司官有如小儿，天下有如此铨司乎？吏部乃是木偶之堂官也！每文选郎出，辄邀之半道，为人求官，不得则加以恶 声，或逐之去。选郎即公正无如何，尚书亦太息而已。”
尽管经过朱载坖的大力整顿，这些事情现在已经相对收敛很多了，在加上方从哲实施铨政新法之后，铨选相对公平一些，但是要是有足够的银子，还是能够在其中做些手脚的。
而陈矩也在向朱载坖奏报东厂所调查到的情况，对于李三才，厂卫的侦查结果是：“外假慷慨论列之名，尽愚天下耳目 内挟贪残态雌之术，不顾一己防，维广布互交潜开三衅，浮慕细衣之好挥金走币，贤愚尽人牢笼。”
李三才为人豪爽大方，视钱财如粪土，每到一地，经常与当地的生员士子、同僚等一道饮酒作乐，纵论天下大事，同时厂卫的奏报说的是很明确的，李三才性不能持廉，在经济上肯定是有很大的问题的，根据厂卫的汇报：“三才豪侠人也，不善自匿饰，又挥金如土，官俸不能支也。”
厂卫奏报李三才挥金如土，而李三才又何以能“挥金如土”呢？ 凭他的家资并不殷实，其父生不好算，初业儒，不就，乃弃去业贾。李三才之父不过一个诚实的小布商，又不是申阁老，有一个富商爸爸，他的这些张狂自然是引起厂卫注意了。
不过厂卫也在奏报中明确说道，不管是巡按御史还是厂卫，现在确实没有逮到李三才贪墨的确凿证据，这点说明李三才的本事还是不小的，现在大明的监察力度还是很大的，在这种情况下，李三才能够捞到钱而又不被御史等揭发，说明李三才确实是点本事的。
朱载坖听完之后说道：“既如此，令东厂逮李三才下北镇抚司。”尽管现在厂卫确实没有拿到李三才贪墨的实证，但是通过厂卫的初步查访，至少可以证明李三才并不干净，这点对于朱载坖来说已经足够了，至于他到底是采用什么手段贪墨的，那是厂卫的事情。
而在北镇抚司，随着锦衣亲军调查的深入，孙鑨的嫌疑确实是逐渐得以减轻，而孙丕扬的嫌疑则是增加了，锦衣亲军最开始是从李三才的乡党开始查起了，因为在官场之中，乡党是极为重要的关系，而李三才的登科录上写得是顺天府通州张家湾，这也并不能算错，其祖父李禄调任北京为官后侨居顺天府通州张家湾，但是李三才的祖籍是西临潼县任村里。
而在现在有嫌疑的官员中，时任吏科都给事中孙丕扬，陕西富平流曲镇南街人，时任吏科给事中张问达，陕西泾阳人，也就是说，从祖籍上来说，这三人是老乡，而且孙丕扬、张问达都是吏科的给事中，尤其是孙丕扬，还是时任吏科都给事中，在铨政中的作用是极大的。
而且很重要的一件事情，就是孙丕扬和李三才等人关系很好，多次公开为李三才等人扬名，这就使得他们的嫌疑极大了，朱应桢于是向朱载坖奏请收悉孙丕扬和张问达于诏狱，得到了朱载坖的御批，朱载坖命令锦衣亲军整理全部案卷，连同驾贴等一道送内阁和刑科，要求签批。
同时朱应桢派出锦衣亲军查检千户所的精干校尉，前往通州李三才的祖宅，予以查抄，从中起获了不少的财物，远远高于李三才的官俸，这下基本可以做实李三才贪墨了。
对于这点朱载坖是早就有所预料，朱载坖再次下达诏书，警告群臣，朦胧推升是决不容许的，嗣后吏部在铨选的时候，凡是因为失职、贪墨、庭杖或者是御批处分的官员，都必须将这些处分写在最前面，凡有这种情况，铨选列入最后，吏科和都察院监察御史要随时监察，发现有敢于包庇、隐匿的，立刻弹劾。
与之沆瀣一气，同谋推升的，加三等论罪，同时对于此案，朱载坖也明确了自己的看法，除了已经被下诏狱的孙丕扬和张问达，陈有年、孙鑨以失察降三级发极边方调用，吏部尚书杨俊民以失察致仕，令左侍郎赵志皋暂署部事，这次朱载坖的处分不可谓不重，不仅仅时任的两位郎中受到严惩，连吏部尚书杨俊民也被牵连致仕，可见朱载坖的愤怒。
第二天朱载坖再次下达上谕，已革职吏部尚书杨俊民，加咨议院副使兼顾问咨询大臣，筹建咨议院以及在南北直隶、顺天府、应天府建立咨议局、咨议处等事项，朱载坖将杨俊民放到了这个位置上，看似远离了朝廷，但是实则可以面陈机宜，虽然不及吏部尚书有权力，但是筹建咨议院也是极为重要的事情。